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丙型肝炎病毒(HCV)核酸检测试剂盒反应流程常规程序

放大字体  缩小字体 发布日期:2021-10-27 14:29:29    浏览次数:57
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丙型肝炎病毒(HCV)核酸检测试剂盒反应流程常规程序

丙型肝炎病毒(HCV)核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)反应流程常规程序:


将PCR反应所需的成分配置完后,在PCR仪上于94-96℃预加热几十秒至几分钟,使模板DNA充分变性,然后进入扩增循环。在每一个循环中,先于94℃保持30秒钟使模板变性,然后将温度降到复性温度(一般50-60℃之间),一般保持30秒钟,使引物与模板充分退火;在72℃保持1分钟(扩增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一个循环。重复这样的循环25~35次,使扩增的DNA段大量累积。最后,在72℃保持3-7min,使产物延伸完整,4℃保存。


2.复性(退火)和延伸温度


复性的温度是PCR扩增是否顺利的关键因素,通常在50-60℃之间。具体的温度主要由引物的Tm值决定。延伸温度绝大多数设定为72℃。如果复性的温度很高,可以将延伸温度和复性温度设置成同一温度,变成二步法PCR。


3.反应时间


变性步骤一般使用30秒钟,如果模板的G+C含量较高,或直接用细胞做模板,变性时间可适当延长。复性时间有30秒种一般是足够的。延伸时间由扩增产物的大小决定,一般采用1kb用1分钟来保证充足的时间。


4.循环次数


循环次数主要与模板的起始数量有关,在模板拷贝数为104~105数量级时,循环数通常为25~35次。


平台效应(plateaueffect):PCR扩增过程后期会出现的产物的积累按减弱的指数速率增长的现象。原因:底物和引物的浓度已经降低,dNTP和DNA聚合酶的稳定性或活性降低,产生的焦磷酸会出现末端产物抑制作用,非特异性产物或引物的二聚体出现非特异性竞争作用,扩增产物自身复性,高浓度扩增产物变性不彻底。


5.PCR反应液的配制


PCR反应体系的配置方式有时也会影响反应的正常进行。常规方法与其它酶学反应一样,在最后加入DNA聚合酶。早期的PCR仪没有带加热的盖子,要求在反应液上覆盖一层矿物油,防止水分蒸发。


对于使用具3’-5’外切活性的高温DNA聚合酶时,有时会扩增不出产物。在遇到这个问题时,如果将反应成分分开配制,A管含模板、引物和dNTP,以及调整体积的H2O,B管含缓冲液、DNA聚合酶和水,然后再将两管溶液混合起来,可较好地克服这个问题。


按照常规的方法配制反应体系,有时会出现非特异性扩增的问题。热启动(hotstart)PCR操作方式可较好解决这一问题。将dNTP、缓冲液,Mg2+和primer先配制好,然后加入一粒蜡珠(如AmpliWaxPCRQam100),加热熔化,再冷却,使蜡将溶液封住,最后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有当PCR反应进入高温阶段后,蜡层熔化,所有反应成分才会混合在一起。

人结直肠腺癌细胞;LS 174T [LS174T]

人乳腺癌细胞;MDA-MB-468

人肺支气管癌细胞;NCI-H1650

人非小细胞肺腺癌细胞;NCI-H1975

人非小细胞肺腺癌细胞;NCI-H2087

人小细胞肺癌;NCI-H2227

人非小细胞肺癌细胞;NCI-H23

人肾上腺皮质腺癌细胞;NCI-H295R

小鼠源细胞

小鼠胚胎成纤维细胞;3T3-Swiss albino

小鼠T淋巴细胞瘤细胞;Cyc-Tag(S49)

小鼠骨髓细胞;FDC-P1

小鼠垂体瘤细胞;GT1-1

小鼠胚胎成骨细胞前体细胞;MC3T3-E1

小鼠胚胎成纤维细胞;NIH/3T3

小鼠睾丸畸胎瘤细胞;P19

小鼠胚胎成纤维细胞(来自NIH3T3);PA12

小鼠血细胞;WEHI-3 [WEHI3]

小鼠成纤维细胞;φ2

小鼠红白血病细胞;MEL

小鼠骨髓瘤细胞;Sp2/0-Ag14

小鼠垂体瘤细胞(分泌促生长激素分泌激素);AtT-20

小鼠小胶质细胞;BV2

小鼠骨髓瘤细胞;Fox-NY

小鼠胚胎成纤维细胞;MEF

小鼠淋巴瘤细胞(NK靶细胞);YAC-1

野生型人c-kit受体细胞株;A7d

小鼠原B细胞株;BaF3

小鼠脑瘤细胞;BC3H1

小鼠成肌细胞;C2C12

小鼠肝癌细胞;Hepa 1-6 [Hepa1-6]

小鼠肥大细胞瘤细胞;P815

小鼠胚胎成纤维细胞;3T6-Swiss albino

小鼠胚胎成纤维细胞;C3H 10T1/2 2A6

小鼠树突状细胞肉瘤细胞;DCS

小鼠淋巴瘤细胞;EL4

小鼠前胃癌细胞;MFC


 
(文/小编)
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