分子杂交仪（又名：分子杂交箱、分子杂交炉）是现代实验室采用杂交技术的理想设备，可替代塑料杂交袋和水浴摇床，并避免杂交袋破损带来污染危险。杂交炉采用微机控温，炉内空气循环装置设计独特，升温速度快等特点。
分子杂交仪其基本原理就是应用核酸分子的变性和复性的性质,使来源不同的DNA(或RNA)片段,按碱基互补关系形成杂交双链分子。杂交双链可以在DNA与DNA链之间,也可在RNA与DNA链之间形成。
方法对比：
分子杂交方法杂交设备相同点优点 Southern杂交电泳仪，电泳槽，塑料盆，真空烤箱，放射自显影盒，X-光片，杂交袋，硝酸纤维素滤膜或尼龙膜，滤纸。
①都是应用复性动力学原理;
②都必须有探针(probe)的存在。所谓探针就是用同位素或非同位素如荧光染料，生物素等标记的短片段特异DNA或RNA序列。检验物是DNA。
杂交电泳仪，电泳槽，塑料盆，真空烤箱，放射自显影盒，X-光片，杂交袋，硝酸纤维素膜或尼龙膜。检验物是RNA，而不是DNA。菌落原位杂交恒温烤箱，恒温水浴，台式高速离心机等。原位杂交可以确定探针的互补序列在胞内的空间位置。斑点杂交狭槽点样器，真空泵，恒温水浴，真空烤箱等。来分析DNA样品之间的同源性。
杂交电泳仪，电泳槽，塑料盆，真空烤箱，放射自显影盒，X-光片，杂交袋，硝酸纤维素膜或尼龙膜
①都是应用复性动力学原理;
②都必须有探针(probe)的存在。所谓探针就是用同位素或非同位素如荧光染料，生物素等标记的短片段特异蛋白质。以亲和反应或免疫反应或结合反应测定蛋白质技术。
分子杂交仪的操作步骤：
1.接通电源，打开开关，进行参数设定。参数设定，接通电源→按“选择”键到相应的参数行→按“设定”键，该行位开始闪烁，进入修改状态→按“置数”键，数字0~9循环到达所需的数字后按“移位”键到下一位数字修改修改完后，按“设定”键确认。按“选择”键可选择修改其他数据或回到正常显示状态。
2.达到所设定的温度后，按“运行”键，试运行30min。
3.按“停止”键，然后将所要杂交的东西放到仪器内，按“运行”键，开始运行。
分子杂交仪使用注意事项：
1、不同型号的箱体容纳的管子数，微孔版数，载波片数和平板数也不同在使用时一定要留意具体说明。
2、使用前要检查供电电源是否符合设备所需的电压。
3、多用于为做分子杂交用，接触同位素的时间比较长，使用时请小心谨慎。
4、在操作中显示屏显示异常，请按一下“复位”按钮便可，不要随意拆卸箱体、
分子杂交仪广泛地使用于克隆基因的筛选、酶切图谱的制作、基因组中特定基因序列的定性、定量检测和疾病的诊断等方面。因而它不仅在分子生物学领域中具有广泛地应用，而且在临床诊断上的应用也日趋增多。
